При реакциях матричного синтеза образуются полимеры, строение которых полностью определяется строением матрицы. В основе реакций матричного синтеза лежит комплементарное взаимодействие между нуклеотидами.
Репликация (редупликация, удвоение ДНК).
Матрица – материнская цепочка ДНК
Продукт –новосинтезированная цепочка дочерней ДНК
Комплементарность между нуклеотидами материнской и дочерней цепочек ДНК.
Двойная спираль ДНК раскручивается на две одинарных, затем фермент ДНК-полимераза достраивает каждую одинарную цепочку до двойной по принципу комплементарности.
Транскрипция (синтез РНК).
Матрица – кодирующая цепочка ДНК
Продукт – РНК
Комплементарность между нуклеотидами кДНК и РНК.
В определенном участке ДНК разрываются водородные связи, получается две одинарных цепочки. На одной из них по принципу комплементарности строится иРНК. Затем она отсоединяется и уходит в цитоплазму, а цепочки ДНК снова соединяются между собой.
Трансляция (синтез белка).
Матрица – иРНК
Продукт – белок
Комплементарность между нуклеотидами кодонов иРНК и нуклеотидами антикодонов тРНК, приносящих аминокислоты.
Внутри рибосомы к кодонам иРНК по принципу комплементарности присоединяются антикодоны тРНК. Рибосома соединяет между собой аминокислоты, принесенные тРНК, получается белок.
Этапы биосинтеза белка у прокариот и эукариот.
У прокариот синтез белка осуществляется в 2 этапа:
1) транскрипция, продукт этой реакции – мРНК;
2) трансляция, продукт этой реакции – полипептид.
Эти этапы могут протекать одновременно т. к. в клетке нет ядерной оболочки.
Процесс синтеза белка у эукариот включает 3 этапа:
1) транскрипция ДНК в про-мРНК (продукт: про-мРНК);
2) процессинг – преобразование про-мРНК в зрелую мРНК;
3) трансляция мРНК в полипептид.
В некоторых случаях для получения активного белка необходимо его химическое преобразование, которое называется посттрансляционной модификацией .
Понятие транскриптона. Особености строения транскриптона у прокариот и эукариот.
Ген вместе со вспомогательными участками называется транскриптоном , следовательно, транскриптон является наименьшей функциональной единицей генома.
Типичный транскриптон содержит: промотор – сигнал начала транскрипции, к которому присоединяется фермент РНК-полимераза; терминатор – сигнал окончания транскрипции; регуляторный участок – оператор , к которому присоединяются управляющие белки активаторы или репрессоры (соответственно облегчают и блокируют транскрипцию); структурный ген .
Строение транскриптона прокариот. У прокариот в состав транскриптона входит два участка: регуляторный и структурный . Эти участки составляют соответственно 10% и 90%. В регуляторном участке содержатся промотор, оператор и терминатор. Структурный участок может быть представлен одним либо несколькими структурными генами. В последнем случае они разделены несмысловыми участками – спейсерами. Такой транскриптон называется опероном .
У эукариот транскриптон также содержит регуляторный и структурный участки, относительная доля которых в противоположность прокариотам составляет 90% и 10%. Регуляторный участок включает несколько промоторов, операторов и терминаторов. Структурные гены могут находиться в разных частях одной хромосомы или даже в разных хромосомах. Структурный участок транскриптона имеет прерывистое (мозаичное) строение: участки, несущие информацию о последовательности аминокислот в белке (кодирующие или экзоны ) чередуются с некодирующими фрагментами (интронами ). Число интронов у различных организмов различно, но, как правило, суммарная длина интронов превышает общую длину экзонов.
Механизмы транскрипции.
Транскрипция – это процесс копирования участка ДНК в виде комплементарной ему про-мРНК (предшественник мРНК), происходит в ядре клетки. Он начинается с присоединения фермента РНК-полимеразы к промотору. ДНК на определенном участке раскручивается, происходит разрыв водородных связей между 2-мя цепями нуклеотидов, в результате образуются 2 отдельные полинуклеотидные цепи. К ним по принципу комплементарности из кариолимфы присоединяются свободные нуклеотиды. Фермент продолжает присоединять нуклеотиды до тех пор, пока не доходит до кодонов-терминаторов. По окончании транскрипции ДНК восстанавливает исходную двуцепочечную структуру, про-мРНК транспортируются в цитоплазму.
Нуклеиновые кислоты.
Впервые нуклеиновые кислоты (НК) были обнаружены в 1869 г. швейцарским биохимиком Фридрихом Мишером.
НК - это линейные неразветвленные гетерополимеры, мономерами которых являются нуклеотиды, связанные фосфодиэфирными связями.
Нуклеотид состоит из:
азотистого основания
Пуриновые (аденин (А) и гуанин (Г) - их молекулы состоят из 2-х колец: 5-ти и 6-ти членного),
Пиримидиновые (цитозин (Ц), тимин (Т) и урацил (У) – одно шестичленное кольцо);
углевода (5-ти углеродное сахарное кольцо): рибоза или дезоксирибоза;
остатка фосфорной кислоты.
Существует 2 типа НК: ДНК и РНК. НК обеспечивают хранение, воспроизведение и реализацию генетической (наследственной) информации. Эта информация закодирована в виде нуклеотидных последовательностей. Последовательность нуклеотидов отражает первичную структуру белков. Соответствие между аминокислотами и кодирующими их нуклеотидными последовательностями называется генетическим кодом . Единицей генетического кода ДНК и РНК является триплет – последовательность из трех нуклеотидов.
Виды азотистых оснований |
А, Г, Ц, Т |
А, Г, Ц, У |
Виды пентоз |
β,D-2-дезоксирибоза |
β,D-рибоза |
Вторичная структура |
Регулярная, состоит из 2-х комплементарных цепей |
Нерегулярная, некоторые участки одной цепи образуют двойную спираль |
Молекулярная масса (число нуклеотидных звеньев в первичной цепи) или от 250 до 1,2х10 5 kDa (килодальтон) |
Порядка тысяч, миллионов |
Порядка десятков и сотен |
Локализация в клетке |
Ядро, митохондрии, хлоропласты, центриоли |
Ядрышко, цитоплазма, рибосомы, митохондрии и пластиды |
Хранение, передача и воспроизведение в ряду поколений наследственной информации |
Реализация наследственной информации |
ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) – это нуклеиновая кислота, мономерами которой являются дезоксирибонуклеотиды; это материнский носитель генетической информации. Т.е. вся информация о структуре, функционировании и развитии отдельных клеток и целостного организма записана в виде нуклеотидных последовательностей ДНК.
Первичная структура ДНК – одноцепочечная молекула (фаги).
Дальнейшая укладка макромолекулы полимера называется вторичной структурой. В 1953 г. Джеймс Уотсона и Френсис Крик открыли вторичную структуру ДНК – двойную спираль. В этой спирали фосфатные группировки находятся снаружи спиралей, а основания – внутри и расположены с интервалом 0,34 нм. Цепи удерживаются вместе водородными связями между основаниями и закручены одна вокруг другой и вокруг общей оси.
Основания в антипараллельных нитях за счет водородных связей образуют комплементарные (взаимодополняемые) пары: А= Т (2 связи) и Г≡ Ц (3 связи).
Явление комплементарности в строении ДНК в 1951 г. обнаружил Эрвин Чаргафф.
Правило Чаргаффа: число пуриновых оснований всегда равно числу пиримидиновых (А+Г)=(Т+Ц).
Третичная структура ДНК – это дальнейшая укладка двуцепочечной молекулы в петли, благодаря водородным связям между соседними витками спирали (суперспирализация).
Четвертичная структура ДНК – это хроматиды (2 нити хромосомы).
Рентгенограммы волокон ДНК, впервые полученные Моррисом Уилкинсом и Розалиндой Франклин, указывают на то, что молекула обладает спиральной структурой и содержит более одной полинуклеотидной цепи.
Существует несколько семейств ДНК: А, В, С, D, Z–формы. В клетках обычно встречается В–форма. Все формы, кроме Z, правозакрученные спирали.
Репликация (самоудвоение) ДНК – это один из важнейших биологических процессов, обеспечивающих воспроизведение генетической информации. Репликация начинается с разделения двух комплементарных цепей. Каждая цепь используется в качестве матрицы для образования новой молекулы ДНК. В процессе синтеза ДНК участвуют ферменты. Каждая из двух дочерних молекул обязательно включает одну старую спираль и одну новую. Новая молекула ДНК абсолютно идентична старой по последовательности нуклеотидов. Такой способ репликации обеспечивает точное воспроизведение в дочерних молекулах той информации, которая была записана в материнской молекуле ДНК.
В результате репликации одной молекулы ДНК образуется две новые молекулы, которые являются точной копией исходной молекулы – матрицы . Каждая новая молекула состоит из двух цепей – одной из родительских и одной из сестринских. Такой механизм репликации ДНК называется полуконсервативным .
Реакции, в которых одна молекула гетерополимера служит матрицей (формой) для синтеза другой молекулы гетерополимера с комплементарной структурой, называются реакциями матричного типа . Если в ходе реакции образуются молекулы того же вещества, которое служит матрицей, то реакция называется автокаталитической . Если же в ходе реакции на матрице одного вещества образуются молекулы другого вещества, то такая реакция называется гетерокаталитической . Таким образом, репликация ДНК (т.е. синтез ДНК на матрице ДНК) является автокаталитической реакцией матричного синтеза.
К реакциям матричного типа относятся:
Репликация ДНК (синтез ДНК на матрице ДНК),
Транскрипция ДНК (синтез РНК на матрице ДНК),
Трансляция РНК (синтез белков на матрице РНК).
Однако существуют и другие реакции матричного типа, например, синтез РНК на матрице РНК и синтез ДНК на матрице РНК. Два последних типа реакций наблюдаются при заражении клетки определенными вирусами. Синтез ДНК на матрице РНК (обратная транскрипция ) широко используется в генной инженерии.
Все матричные процессы состоят из трех этапов: инициации (начала), элонгации (продолжения) и терминации (окончания).
Репликация ДНК – это сложный процесс, в котором принимает участие несколько десятков ферментов. К важнейшим из них относятся ДНК-полимеразы (несколько типов), праймазы, топоизомеразы, лигазы и другие. Главная проблема при репликации ДНК заключается в том, что в разных цепях одной молекулы остатки фосфорной кислоты направлены в разные стороны, но наращивание цепей может происходить только с того конца, который заканчивается группой ОН. Поэтому в реплицируемом участке, который называется вилкой репликации , процесс репликации протекает на разных цепях по-разному. На одной из цепей, которая называется ведущей, происходит непрерывный синтез ДНК на матрице ДНК. На другой цепи, которая называется запаздывающей, вначале происходит связывание праймера – специфического фрагмента РНК. Праймер служит затравкой для синтеза фрагмента ДНК, который называется фрагментом Оказаки . В дальнейшем праймер удаляется, а фрагменты Оказаки сшиваются между собой в единую нить фермента ДНК–лигазы. Репликация ДНК сопровождается репарацией – исправлением ошибок, неизбежно возникающих при репликации. Существует множество механизмов репарации.
Репликация происходит перед делением клетки. Благодаря этой способности ДНК осуществляется передача наследственной информации от материнской клетки дочерним.
РНК (рибонуклеиновая кислота) – это нуклеиновая кислота, мономерами которой являются рибонуклеотиды.
В пределах одной молекулы РНК имеется несколько участков, которые комплементарны друг другу. Между такими комплементарными участками образуются водородные связи. В результате в одной молекуле РНК чередуются двуспиральные и односпиральные структуры, и общая конформация молекулы напоминает клеверный лист.
Азотистые основания, входящие в состав РНК, способны образовывать водородные связи с комплементарными основаниями и ДНК, и РНК. При этом азотистые основания образуют пары А=У, А=Т и Г≡Ц. Благодаря этому возможна передача информации от ДНК к РНК, от РНК к ДНК и от РНК к белкам.
В клетках обнаруживается три основных типа РНК, выполняющих различные функции:
1. Информационная , или матричная РНК (иРНК, или мРНК). Функция: матрица белкового синтеза. Составляет 5% клеточной РНК. Передает генетической информации от ДНК на рибосомы при биосинтезе белка. В эукариотических клетках иРНК (мРНК) стабилизирована с помощью специфических белков. Это делает возможным продолжение биосинтеза белка даже в том случае, если ядро неактивно.
мРНК представляет собой линейную цепь с несколькими областями с разной функциональной ролью:
а) на 5"-конце находится кэп («колпачок») – защищает мРНК от экзонуклеаз,
б) за ним идет нетранслируемый участок, комплементарный отделу рРНК, которая входит в малую субъединицу рибосомы,
в) трансляция (считывание) мРНК начинается с инициирующего кодона АУГ, кодирующего метионин,
г) за инициирующим кодоном следует кодирующая часть, которая содержит информацию о последовательности аминокислот в белке.
2. Рибосомная , или рибосомальная РНК (рРНК). Составляет 85% клеточной РНК. В соединении с белком входит в состав рибосом, определяет форму большой и малой рибосомных субъединиц (50-60S- и 30-40S-субъединиц). Принимают участие в трансляции – считывании информации с иРНК в синтезе белка.
Субъединицы и входящие в них рРНК принято обозначать по их константе седиментации. S - коэффициент седиментации, единицы Сведберга. Величина S характеризует скорость оседания частиц при ультрацентрифугировании и пропорциональна их молекулярной массе. (Так, например, рРНК прокариот с коэффициентом седиментации 16 единиц Сведберга обозначается как 16S рРНК).
Т.о., выделяют несколько видов рРНК, различающихся по длине полинуклеотидной цепи, массе и локализации в рибосомах: 23-28S, 16-18S, 5S и 5,8S. И прокариотическая, и эукариотическая рибосомы содержат 2 различные высокополимерные РНК, по одной на каждую субъединицу, и одну низкомолекулярную РНК - 5S РНК. Эукариотические рибосомы также содержат и низкомолекулярную 5,8S РНК. Н-р, у прокариот синтез 23S, 16S и 5S рРНК, у эукариот - 18S, 28S, 5S и 5,8S.
80S-рибосома (эукариотическая)
Малая 40S субъединица Большая 60S субъединица
18SрРНК (~2000 нуклеотидов), - 28SрРНК (~4000 н.),
5,8SрРНК (~155 н.),
5SрРНК (~121 н.),
~30 белков. ~45 белков.
70S-рибосома (прокариотическая)
Малая 30S субъединица Большая 50S субъединица
16SрРНК, - 23SрРНК,
~20 белков. ~30 белков.
Большая молекула высокополимерной рРНК (константа седиментации 23-28S, локализована в 50-60S субъединицах рибосом.
Малая молекула высокополимерной рРНК (константа седиментации 16-18S, локализована в 30-40S субъединицах рибосом.
Во всех без исключения рибосомах присутствует низкополимерная 5S рРНК, локализована в 50-60S субъединицах рибосом.
Низкополимерная рРНК с константой седиментации 5,8S характерна только для эукариотических рибосом.
Т.о., в состав рибосом входит три типа рРНК у прокариот и четыре типа рРНК у эукариот.
Первичная структура рРНК - одна полирибонуклеотидная цепь.
Вторичная структура рРНК – спирализация самой на себя полирибонуклеотидной цепи (отдельные участки цепи РНК образуют спирализованные петли – «шпильки»).
Третичная структура высокополимерных рРНК - взаимодействия спирализованных элементов вторичной структуры.
3. Транспортная РНК (тРНК). Составляет 10% клеточной РНК. Переносит аминокислоту к месту синтеза белка, т.е. к рибосомам. Для каждой аминокислоты имеется своя тРНК.
Первичная структура тРНК – одна полирибонуклеотидная цепь.
Вторичная структура тРНК – модель «клеверный лист», в этой структуре 4 двухцепочечных и 5 одноцепочечных участков.
Третичная структура тРНК – стабильная, молекула сворачивается в Г-образную структуру (2 почти перпендикулярных друг другу спирали).
Все типы РНК образуются в результате реакций матричного синтеза. В большинстве случаев матрицей служит одна из цепей ДНК. Таким образом, биосинтез РНК на матрице ДНК является гетерокаталитической реакцией матричного типа. Этот процесс называется транскрипцией и контролируется определенными ферментами – РНК–полимеразами (транскриптазами).
Синтез РНК (транскрипция ДНК) заключается в переписывании информации с ДНК на мРНК.
Отличия синтеза РНК от синтеза ДНК:
Асимметричность процесса: в качестве матрицы используется лишь одна цепь ДНК.
Консервативность процесса: молекула ДНК по окончании синтеза РНК возвращается в исходное состояние. При синтезе ДНК молекулы наполовину обновляются, что делает репликацию полуконсервативной.
Синтез РНК не требует для своего начала никакой затравки, а при репликации ДНК необходима РНК-затравка.
Третичная структура РНК
Вторичная структура РНК
Молекула рибонуклеиновой кислоты построена из одной полинуклеотидной цепи. Отдельные участки цепи РНК образуют спирализованные петли - "шпильки", за счёт водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями A-U и G-C. Участки цепи РНК в таких спиральных структурах антипараллельны, но не всегда полностью комплементарны, в них встречаются неспаренные нуклеотидные остатки или даже одноцепочечные петли, не вписьюающиеся в двойную спираль. Наличие спирализованных участков характерно для всех типов РНК.
Одноцепочечные РНК характеризуются компактной и упорядоченной третичной структурой, возникающей путём взаимодействия спирализованных элементов вторичной структуры. Так, возможно образование дополнительных водородных связей между нуклеотидными остатками, достаточно удалёнными друг от друга, или связей между ОН-группами остатков рибо-зы и основаниями. Третичная структура РНК стабилизирована ионами двухвалентных металлов, например ионами Mg 2+ , связывающимися не только с фосфатными группами, но и с основаниями.
При реакциях матричного синтеза образуются полимеры, строение которых полностью определяется строением матрицы. В основе реакций матричного синтеза лежит комплементарное взаимодействие между нуклеотидами.
Репликация (редупликация, удвоение ДНК)
Матрица
– материнская цепочка ДНК
Продукт
– новосинтезированная цепочка дочерней ДНК
Комплементарность
между нуклеотидами материнской и дочерней цепочек ДНК
Двойная спираль ДНК раскручивается на две одинарных, затем фермент ДНК-полимераза достраивает каждую одинарную цепочку до двойной по принципу комплементарности.
Транскрипция (синтез РНК)
Матрица
– кодирующая цепочка ДНК
Продукт
– РНК
Комплементарность
между нуклеотидами кДНК и РНК
В определенном участке ДНК разрываются водородные связи, получается две одинарных цепочки. На одной из них по принципу комплементарности строится иРНК. Затем она отсоединяется и уходит в цитоплазму, а цепочки ДНК снова соединяются между собой.
Трансляция (синтез белка)
Матрица
– иРНК
Продукт
– белок
Комплементарность
между нуклеотидами кодонов иРНК и нуклеотидами антикодонов тРНК, приносящих аминокислоты
Внутри рибосомы к кодонам иРНК по принципу комплементарности присоединяются антикодоны тРНК. Рибосома соединяет между собой аминокислоты, принесенные тРНК, получается белок.
7. Образование полипептидной цепи из последовательно доставляемых к мРНК тРНК с соответствующими аминокислотами происходит на рибосомах (рис. 3.9).
Рибосомы представляют собой нуклеопротеидные структуры, в которые входят три вида рРНК и более 50 специфических рибосомных белков. Рибосомы состоят из малой и большой субъединиц. Инициация синтеза полипептидной цепи начинается с присоединения малой субъединицы рибосомы к центру связывания на мРНК и всегда происходит при участии метиониновой тРНК особого типа, которая связывается с метиониновым кодоном АУГ и прикрепляется к так называемому Р-участку большой субъединицы рибосомы .
Рис. 3.9. Синтез полипептиднои цепи на рибосоме Показаны также транскрипция мРНК и ее перенос через ядерную мембрану в цитоплазму клетки.
Следующий кодон мРНК , расположенный вслед за АУГ-инициирующим кодоном, попадает в А-участок большой субъединицы рибосомы , где он «подставляется» для взаимодействия с амино-ацил-тРНК, имеющей соответствующий антикодон. После того как подходящая тРНК связалась с кодоном мРНК, находящимся в А-участке, происходит образование пептидной связи с помощью пептидилтрансферазы, входящей в состав большой субъединицы рибосомы, и аминоацил-тРНК превращается в пептидил-тРНК. Это заставляет рибосому продвинуться на один кодон, переместить образованную пептидил-тРНК в Р-участок и освободить А-участок, который занимает следующий по порядку кодон мРНК, готовый к соединению с аминоацил-тРНК, имеющей подходящий антикодон (рис. 3.10).
Происходит рост полипептидной цепи за счет многократного повторения описанного процесса. Рибосома движется вдоль мРНК , высвобождая ее инициирующий участок. На инициирующем участке происходит сборка следующего активного рибосомного комплекса и начинается синтез новой полипептидной цепи. Таким образом к одной молекуле мРНК может присоединиться несколько активных рибосом с образованием полисомы. Синтез полипептида продолжается до тех пор, пока в А-участке не окажется один из трех стоп-кодонов. Стоп-кодон распознается специализированным белком терминации, который прекращает синтез и способствует отделению полипептидной цепи от рибосомы и от мРНК .
Рис. 3.10. Синтез полипептидной цепи на рибосоме . Детализованная схема присоединения к растущей полипептидной цепи новой аминокислоты и участие в этом процессе участков А и Р большой субъединицы рибосомы.
Рибосома и мРНК также разъединяются и готовы начать новый синтез полипептидной цепи (см. рис. 3.9). Остается только напомнить, что белки - это основные молекулы, обеспечивающие жизнедеятельность клетки и организма. Они и ферменты, обеспечивающие весь сложнейший обмен веществ, и структурные белки, составляющие скелет клетки и образующие межклеточное вещество, и белки-транспортеры многих веществ в организме, как, например, гемоглобин, транспортирующий кислород и белки-каналы, обеспечивающие проникновение в клетку и удаление из нее разнообразных соединений.
а) На рибосомах гранулярной ЭПС синтезируются такие белки, которые затем
Либо выводятся из клетки (экспортные белки),
либо входят в состав определённых мембранных структур (собственно мембран, лизосом и т.д.).
б) При этом синтезируемая на рибосоме пептидная цепь проникает своим лидерным концом через мембрану в полость ЭПС, где затем оказывается весь белок и формируется его третичная структура.
2. Здесь же (в просвете цистерн ЭПС) начинается модификация белков - связывание их с углеводами или иными компонентами.
8. Механизмы клеточного деления.
В основе передачи и реализации наследственной информации лежат реакции матричного синтеза. Их всего три: репликация ДНК, транскрипция и трансляция. Все эти реакции относятся к реакциям пластического обмена, требуют затрат энергии и участия ферментов.
Репликация.
Репликация – самоудвоение молекул ДНК – лежит в основе передачи наследственной информации из поколения в поколение. В результате репликации одной материнской молекулы ДНК образуются две дочерние, каждая из которых представляет собой двойную спираль, в которой одна нить ДНК – материнская, а другая вновь – синтезированная. Для репликации необходимы различные ферменты, нуклеотиды и энергия.
С помощью особых ферментов разрываются водородные связи, соединяющие комплементарные основания двух цепей материнской ДНК. Нити ДНК расходятся. Молекулы фермента ДНК-полимеразы движутся вдоль материнских цепей ДНК и последовательно соединяют нуклеотиды, формируя дочерние цепи ДНК. Процесс присоединения нуклеотидов идет по принципу комплементарности. В результате формируются две молекулы ДНК идентичные материнской и друг другу.
Биосинтез белка.
Биосинтез белка, т.е. процесс реализации наследственной информации, протекает в два этапа. На первом этапе информация о первичной структуре белка переписывается с ДНК на иРНК. Этот процесс называется транскрипцией. Второй этап – трансляция – происходит на рибосомах. В ходе трансляции происходит синтез белка из аминокислот в соответствии с последовательностью записанной в иРНК, т.е. последовательность нуклеотидов переводится в последовательность аминокислот. Таким образом, процесс реализации наследственной информации можно выразить схемой:
ДНК → иРНК → белок → свойство, признак
Транскрипция – синтез информационной РНК на матрице ДНК. Данный процесс происходит там, где есть ДНК. У эукариот транскрипция происходит в ядре, митохондриях и хлоропластах (у растений), а у прокариот непосредственно в цитоплазме. При транскрипции молекула ДНК является матрицей, а иРНК продуктом реакции.
Транскрипция начинается с разделения цепей ДНК, которое происходит также как при репликации (водородные связи разрываются с помощью ферментов). Затем фермент РНК-полимераза последовательно по принципу комплементарности соединяет нуклеотиды в цепь, синтезируя молекулу иРНК. Образовавшаяся молекула иРНК отделяется и направляется в цитоплазму «на поиски» рибосомы.
Синтез белка на рибосомах называется трансляцией . Трансляция у эукариот происходит на рибосомах, которые находятся в цитоплазме, на поверхности ЭПС, в митохондриях и в хлоропластах (у растений), а у прокариот на рибосомах в цитоплазме. В трансляции участвуют иРНК, тРНК, рибосомы, аминокислоты, молекулы АТФ, ферменты.
· Аминокислоты служат материалом для синтеза молекулы белка.
· АТФ является источником энергии для соединения аминокислот друг с другом.
· Ферменты участвуют в присоединении аминокислот к тРНК и в соединении аминокислот друг с другом.
· Рибосомы состоят из молекул рРНК и белка, формирующих активный центр, в котором и происходят основные события трансляции.
· Информационная РНК в данном случае является матрицей для синтеза молекулы белка. Триплеты иРНК, каждый из которых кодирует какую-то аминокислоту, называются кодонами .
· Транспортные РНК подносят аминокислоты к рибосомам и участвуют в переводе последовательности нуклеотидов в последовательность аминокислот. Транспортные РНК, как и другие виды РНК, синтезируются на матрице ДНК. Они имеют вид клеверного листа (рис. 28.3). Три нуклеотида, расположенные на вершине центральной петли молекулы тРНК образуют антикодон .
Ход трансляции.
Трансляция начинается со связывания иРНК с рибосомой. Рибосома движется по иРНК, каждый раз перемещаясь на один триплет. В активном центре рибосомы могут одновременно находиться два триплета (кодона) иРНК. К каждому из этих кодонов подходит тРНК, имеющая комплементарный антикодон и несущая определенную аминокислоту. Между кодонами и антикодонами образуются водородные связи, удерживающие тРНК в активном центре. В это время образуется пептидная связь между аминокислотами. Растущая полипептидная цепь «подвешивается» на тРНК, которая вошла в активный центр последней. Рибосома продвигается на один триплет вперед, в результате чего в активном центре оказывается новый кодон и соответствующая тРНК. Освободившаяся тРНК отделяется от иРНК и отправляется за новой аминокислотой.
Репликация
Процесс редупликации ДНК идет в ядре под действием ферментов и специальных белковых комплексов. Принципы удвоения ДНК:
- * Антипараллельность : дочерняя цепь синтезируется в направлении от 5" к 3" концу.
- * Комплиментарность : строение дочерней нити ДНК определяется последовательностью нуклеотидов материнской нити, подбираются по принципу комплиментарности.
- * Полунепрерывность : одна из двух цепей ДНК - лидирующая , синтезируется непрерывно, а другая - запаздывающая , прерывисто с образованием коротких фрагментов Оказаки . Это происходит из-за свойства антипараллельности.
- * Полуконсервативность : молекулы ДНК, полученные в ходе редупликации, содержат одну консервативную материнскую нить и одну синтезированную дочернюю.
- 1) Инициация
Начинается с репликативной точки , к которой присоединяются белки, инициирующие репликацию. Под действием ферментов ДНК-топоизомеразы и ДНК-геликазы цепь раскручивается, и разрываются водородные связи. Далее идет фрагментарное разъединение двойной цепи ДНК с образованием репликационной вилки . Ферменты предотвращают повторное соединение цепей ДНК.
2) Элонгация
Синтез дочерней цепи ДНК идет за счет фермента ДНК-полимеразы , который движется в направлении 5" 3" , подбирая нуклеотиды по принципу комплиментарности. Лидирующая цепь синтезируется непрерывно, а запаздывающая - прерывисто. Фермент ДНК-лигаза соединяет между собой фрагменты Оказаки . Специальные корректирующие белки распознают ошибки и устраняют неправильные нуклеотиды.
3) Терминация
Окончание репликации происходит, если встречаются две репликационные вилки. Белковые компоненты снимаются, молекулы ДНК спирализуются.
Свойства генетического кода
- * Триплетен - каждую аминокислоту кодирует код из 3 нуклеотидов.
- * Однозначен - каждый триплет кодирует лишь определенную кислоту.
- * Вырожден - каждая аминокислота кодируется несколькими триплетами (2-6). Лишь две из них кодируются одним триплетом: триптофан и метионин.
- * Неперекрываем - каждый кодон является самостоятельной единицей, а генетическая инф считывается только одним способом в одном направлении
- * Универсален - един для всех организмов. Одни и те же триплеты кодируют одни и те же аминокислоты у разных организмов.
Генетический код
Реализация наследственной информации идет по схеме ген-белок-признак.
Ген - участок молекулы ДНК, который несет информацию о первичной структуре одной молекулы белка и отвечает за ее синтез.
Генетический код - принцип кодирования наследственной инф в клетке. Представляет собой последовательность триплетов нуклеотидов в НК, которая задает определенный порядок аминокислот в белках. Инфа, заключенная в линейной последовательности нуклеотидов, используется для создания другой последовательности.
Из 4 нуклеотидов можно составить 64 триплета , 61 из которых кодируют аминокислоты. Стоп-кодоны - триплеты УАА, УАГ, УГА прекращают синтез полипептидной цепи.
Старт-кодон - триплет АУГ определяет начало синтеза полипептидной цепи.
Биосинтез белка
Один из основных процессов пластического обмена веществ. Часть реакций протекает в ядре, другая - в цитоплазме. Необходимые компоненты: АТФ, ДНК, и-РНК, т-РНК, р-РНК, Mg 2+ , аминокислоты, ферменты. Состоит из 3 х процессов:
- - транскрипция : синтез иРНК
- - процессинг : превращение иРНК в мРНК
- - трансляция : синтез белка
ДНК содержит информацию о структуре белка в виде последовательности аминокислот, но поскольку гены не покидают ядра, то непосредственного участия в биосинтезе белковой молекулы не принимают. И-РНК синтезируется в ядре клетки по ДНК и переносит инф от ДНК к месту синтеза белка (рибосомам). Затем, с помощью т-РНК из цитоплазмы выбираются комплиментарные и-РНК аминокслоты. Таким образом синтезируются полипептидые цепи.
Транскрипция
1) Инициация
Синтез молекул иРНК по ДНК может протекать в ядре, митохондриях и пластидах. Под действием ферментов ДНК-геликазы и ДНК-топоизомеразы участок молекулы ДНК раскручивается , разрываются водородные связи. Считывание информации идет только с одной нити ДНК, которая называется кодирующей кодогенной . Фермент РНК-полимераза соединяется с промотером - зоной ДНК, которая содержит старт-сигнал ТАТА.
2) Элонгация
Процесс выстраивания нуклеотидов по принципу комплиментарности . РНК-полимераза продвигается по кодирующей цепи и соединяет между собой нуклеотиды, образуя полинуклеотидную цепь. Процесс продолжается до стоп-кодона .
3) Терминация
Окончание синтеза: фермент и синтезированная молекула РНК отделяеются от ДНК, двойная спираль ДНК восстанавливается.
Процессинг
Превращение молекулы иРНК в мРНК в ходе сплайсинга в ядре под действием ферментов. Идет удаление интронов -участков, не несущих инф об аминокислотной последовательности и сшивание экзонов - участков, кодирующих последовательность аминокислот. Далее идет присоединение стоп-кодона АУГ, кэпирование для 5" конца и полиаденилирование для защиты 3" конца. Образуется зрелая м-РНК, она короче и идет к рибосомам.
Трансляция
Процесс перевода нуклеотидной последовательности триплетов м-РНК в аминокислотную последовательность полипептидной цепи. Идет в цитоплазме на рибосомах.
1) Инициация
Синтезированная мРНК через ядерные поры идет в цитоплазму, где с помощью ферментов и энергии АТФ соединяется с малой субъединицей рибосом. Затем инициаторная тРНК с аминокислотой метианин соединяется с пептидильным центром. Далее в присутствии Mg 2+ идет присоединение большой субъединицы.
2) Элонгация
Удлинение белковой цепи. Аминокислоты с помощью собственной тРНК доставляются к рибосомам. По форме молекулы т-РНК напоминают трилистник, на среднем из которых имеется антикодон , комплиментарный нуклеотидам кодона м-РНК. К противоположному основанию молекулы тРНК присоединяется соответствующая аминокислота.
Первая т-РНК закрепляется в пептидильном центре, а вторая - в аминоациальном . Затем аминокислоты сближаются и между ними образуется пептидная связь, возникает дипептид, первая т-РНК уходит в цитоплазму. После этого, рибосома делает 1 трехнуклеотидный шаг по м-РНК. В результате чего, вторая т-РНК оказывается в пептидильном центре, освобождая аминоацильный. Процесс присоединения аминокислокты идет с затратой энергии АТФ и требует наличия фермента аминоацил-т-РНК-синтетаза .
3) Терминация
Когда в аминоациальный центр попадает стоп-кодон, синтез завершается, и к последней аминокислоте присоединяется вода. Рибосома снимается с м-РНК и распадается на 2 субъединицы, т-РНК возвращается в цитоплазму.
Похожие статьи